La Liga Profesional de Ecuador organiza los torneos nacionales de fútbol de esta temporada y por ello, con el aval de la Federación Ecuatoriana de Fútbol (FEF), definió el sistema de repartición de cupos para los torneos organizados por la Confederación Sudamericana de Fútbol (Conmebol). Las posiciones en la fase regular, o de clasificación, será importante.
"El equipo Campeón y Vicecampeón de la LigaPro, obtendrán el cupo directo a la fase de grupos de la Copa Conmebol Libertadores (Ecuador 1 y Ecuador 2). Para conocer quién se quedará con el tercer puesto y así sucesivamente con el resto de cupos para las competencias Conmebol, se lo hará según su ubicación final en la tabla acumulada de la fase clasificatoria (No incluye la sumatoria de puntos en los partidos ya jugados en playoffs)", explicó la Liga Pro en un comunicado de prensa.
Hay que recordar que el cupo restante a la Copa Sudamericana, porque la FEF tiene cuatro representantes en este certamen, será otorgado al campeón de la Copa Ecuador.
Los cupos para clubes ecuatorianos para torneos Conmebol 2020 se repartirán así:
| Copa Libertadores Ecuador 1 (Fase de Grupos) | Campeón Liga Pro |
| Copa Libertadores Ecuador 2 (Fase de Grupos) | Subcampeón Liga Pro |
| Copa Libertadores Ecuador 3 (Fase 2) | Tercer puesto Liga Pro - Fase Clasificatoria |
| Copa Libertadores Ecuador 4 (Fase 1) | Cuarto puesto Liga Pro - Fase Clasificatoria |
| Copa Sudamericana Ecuador 1 | Campeón Copa Ecuador |
| Copa Sudamericana Ecuador 2 | Quinto puesto Liga Pro - Fase Clasificatoria |
| Copa Sudamericana Ecuador 3 | Sexto puesto Liga Pro - Fase Clasificatoria |
| Copa Sudamericana Ecuador 4 | Séptimo puesto Liga Pro - Fase Clasificatoria |